BioLINCC数据库使用指南及案例

发布时间： 2024-10-14 13:49:06

PART 01

数据库概述

——1.1背景信息——

BioLINCC（Biologic Specimen and Data Repository for NHLBI Studies）是由美国国家心肺血液研究所（National Heart, Lung, and Blood Institute，NHLBI）于2008年建立的数据库。其旨在协助科研人员方便地获取研究数据，提高NHLBI资助项目的转化率。BioLINCC 网站于 2009 年推出，其中包含 38 个生物样本集合和来自 108 项研究的数据。到第四年在线年末，已链接并发布了 2600 个生物样本集合，并提供了 381 项研究的数据以供索取。到第四年年底，注册用户数量接近 851 人，并且继续显示出每年新用户增长率的趋势。BioLINCC 已满足 600 个请求，包括 75 个数据收集，以及 154 个教学数据集请求和 147 个数据更新协议。

——1.2数据库用途——

国家心肺血液研究所 (NHLBI) 生物样本和数据存储库由两个实体项目组成：①生物样本存储库 (Biorepository)，由NHLBI、血液疾病和资源部、输血部管理医学和细胞治疗科；以及②NHLBI 数据存储库，由NHLBI、心血管科学部 (DCVS)、流行病学科管理。这两个项目使命相似，即通过向合格的研究人员提供对存储生物样本和数据收集的访问权限，以此加强和促进心血管病、肺部和血液疾病的进一步研究。

——1.3数据采集方式——

美国国立卫生研究院（NIH）下属的国家心肺血液研究所（NHLBI）于 1976 年建立了一个生物储存库，最初存档了基于人群的血液制品安全调查的生物样本。后来它扩展到来自心脏、肺和血液疾病的临床和流行病学研究的生物样本。NHLBI 还在 2000 年建立了一个数据存储库，用于存储和分发来自 NHLBI 赞助的研究的研究数据。NHLBI 生物标本和数据存储库信息协调中心（BioLINCC）成立于 2008 年，旨在开发链接这两个相关 NHLBI 存储库内容所需的基础设施，促进对存储库资源的访问，并简化请求流程。

——1.4样本特征——

NHBLI生物标本数据库负责获取、储存生物标本，同时将质量合格的生物样本分配给科研人员。早期BioLINCC生物数据库的标本主要包括血浆、血清以及全血，这些标本来源于研究供血和受血患者的几项临床研究。近几年，生物数据库还包含了来源于心血管、肺部疾病以及血液系统疾病研究的标本。NHBLI临床研究数据主要来源于最近70多年以来的流行病学研究和临床研究，包含来自于145家中心临床注册研究和观察性研究的数十万患者数据。来源于临床注册研究的数据包含患者基线资料、中期随访信息、辅助研究以及预后资料（包含实验室检查）。

PART 02

使用方式

——2.1访问和获取——

BioLINCC 网站还提供了一个用于处理请求的私人工作区。需要注册才能从 NHLBI 生物制剂和数据存储库请求资源。希望访问网站全部功能的 BioLINCC 网站访问者需要注册。注册既快速又免费。在注册请求中提交用户的联系信息后，一封自动确认电子邮件将发送到指定的电子邮件地址。单击随附的链接可建立帐户并启用对站点的私有工作区功能的访问。

——2.2数据使用指南——

访问者通过在 BioLINCC 网站输入关键词可以搜索感兴趣的研究项目，如需获取某项研究的数据或者生物样本需要在网站进行注册并完成在线申请流程和提交相关材料文件。

相关材料包括研究方案、伦理审查委员会批件、研究者简历、网站申请表、数据原单位授权使用同意书，等待 NHLBI 人员审批通过之后方可获得。

PART 03

数据类型

数据集本身有两种类型：用于 NHLBI 存档目的的私人、未编辑的研究数据，以及为删除个人标识符（例如，姓名、具体日期、地址、诊所位置、社会安全号码等）或折叠或重新编码数据（例如，将年龄重新编码为年龄分组，将特定异常值重新编码为高端或低端分组）而编辑的公共研究数据，以确保无法轻易识别研究参与者。大多数数据包中还包括文件，通常称为 README 文件，它为数据接收者提供有关研究历史及其进行方式、研究过程中任何关键事件或研究方法变化的信息，以及在创建公共数据集时应用的编辑和代码折叠的详细信息。

PART 04

研究案例

2022年7月美国马里兰州巴尔的摩市约翰霍普金斯大学医学院学者在《Front Med (Lausanne)》（二区top, IF=3.1）发标题为：“Plasma Proprotein Convertase Subtilisin/kexin Type 9 (PCSK9) in the Acute Respiratory Distress Syndrome”的研究论文。文章基于 NIH BioLINCC 数据存储库的数据和血浆样本，组建了一个由 1,577 名急性呼吸窘迫综合征（ARDS）患者组成的队列，这些患者参加了两项先前完成的临床试验，即 EDEN 和 SAILS。使用 Cox 比例风险模型评估了 PCSK9 与死亡率的相关性。还评估了与 PCSK9 水平相关的临床因素。血浆 PCSK9 与 ARDS 患者的死亡率无关，但较高的 PCSK9 水平与无 ICU 和无呼吸机天数较少的次要结局相关。

2021年11月伊利诺伊州芝加哥市芝加哥市芝加哥大学医学院心脏病学部学者在《J Card Fail》（二区top, IF=6.7）发标题为：“Improved Prognostic Performance of Cardiac Power Output With Right Atrial Pressure: A Subanalysis of the ESCAPE Trial”的研究论文。文章基于 Biolincc 数据库，从 ESCAPE 试验中获得了患者水平的数据。在单变量 logistic 回归中，CPO 与主要结局无关（比值比 0.32,95% 置信区间 0.08-1.29，P = .11），但 CPO-RAP 相关（比值比 0.10,95% 置信区间 0.02-0.54，P < .01）。在 Kaplan-Meier 分析中，CPO 的结局无显著差异（76% vs 64%，P = .08），但 CPO-RAP 的结局存在显著差异（81% vs 63%，P = .01）。结果表明，纳入 RAP 导致与主要结局显著相关;仅靠 CPO 就不是。

2018年10月山东大学公共卫生学院生物统计学系学者在《Diabetologia》（一区top, IF=8.4）发标题为：“Trajectories of childhood BMI and adult diabetes: the Bogalusa Heart Study”的研究论文。文章基于 Biolincc 数据库，描述儿童时期 BMI 的纵向概况，并检查与水平无关的儿童 BMI 轨迹对成人 2 型糖尿病的影响。模型估计的儿童年龄点BMI水平和线性斜率分别以1年为间隔，使用生长曲线参数及其一阶导数计算。结果表明，儿童期至成年期BMI符合三次生长曲线;线性和非线性曲线参数在种族-性别组之间存在显著差异。儿童 BMI 轨迹对成人糖尿病有重大影响，与 BMI 水平无关，青春期是晚年糖尿病发展的关键窗口期。

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