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中国学者发现RA新易感基因VOPP1:基于MR分析的机制研究

发布时间:  2025-08-20 11:15:14

2025年8月2日,《J Inflamm Res》刊登一项中国学者的孟德尔随机化(MR, Mendelian Randomization)研究,系统评估了表达数量性状位点(eQTLs, expression quantitative trait loci)、代谢物与类风湿关节炎(RA, rheumatoid arthritis)风险的因果关系,筛选出新的易感基因VOPP1(vesicular overexpressed in cancer pro-survival protein 1),并探讨了其作用机制。



摘要

方法:研究于2023年1月至2024年6月在南通大学附属医院开展,收集关节手术患者滑膜组织样本。VOPP1功能在体外通过RA成纤维样滑膜细胞(RA-FLSs, fibroblast-like synoviocytes)和体内胶原诱导性关节炎(CIA, collagen-induced arthritis)大鼠模型验证。VOPP1表达水平采用定量实时PCR和Western Blot检测,并评估其对细胞增殖、炎性因子表达及p38丝裂原活化蛋白激酶(p38 MAPK, mitogen-activated protein kinase)信号通路激活的影响。

结果:首次证实VOPP1 eQTL可增加RA风险,且可正向调控代谢物X−23,587水平,进一步加重RA风险。VOPP1在RA滑膜组织及RA-FLSs中显著高表达,通过激活p38 MAPK信号通路促进RA-FLSs增殖和炎症反应。CIA模型中,敲低VOPP1可减轻关节损伤和滑膜炎症。

结论:VOPP1是新的RA易感基因,可能通过升高X−23,587水平并激活p38 MAPK信号通路促进疾病进展。


结果

1. MR分析发现VOPP1是RA新易感基因

MR设计分三步:步骤1,将19,942个eQTLs作为暴露因素,RA为结局;步骤2,将1,400种代谢物作为暴露因素,RA为结局;步骤3,以VOPP1 eQTL为暴露因素,74种代谢物为结局。步骤1结果显示,具有VOPP1 eQTL遗传风险的个体RA风险升高,异质性和多效性检验无异常,敏感性分析支持这一结果。

2. VOPP1在RA滑膜组织和RA-FLSs中高表达

GSE55457数据库分析、qPCR及Western Blot均显示,RA滑膜组织VOPP1表达显著高于正常对照(NC),RA-FLSs中VOPP1蛋白水平亦显著升高。

3. 潜在机制:调控X−23,587水平

步骤2和3结果表明,VOPP1 eQTL与X−23,587代谢物水平升高显著相关,且该代谢物水平升高也增加RA风险,提示VOPP1可能通过调控X−23,587水平促进RA发生。

4. 激活p38 MAPK促进增殖与炎症

敲低VOPP1后,RA-FLSs中p-p38水平下降,加入p38 MAPK激动剂Anisomycin后部分恢复。流式细胞术和EdU实验显示,VOPP1敲低抑制细胞增殖,Anisomycin可部分逆转。ELISA检测发现,VOPP1敲低降低TNF-α和IL-6分泌,激活p38 MAPK可削弱此抑制作用,表明VOPP1依赖p38 MAPK通路促进RA-FLSs增殖与炎症反应。

5. 体内实验:敲低VOPP1减轻CIA症状

CIA模型中,注射VOPP1 siRNA显著改善关节炎指数和足肿胀,病理染色显示骨破坏、软骨退变、滑膜增生减轻,TNF-α和IL-6水平下降。


研究方法

1. 孟德尔随机化研究设计

本研究遵循《流行病学观察性研究报告加强声明》(STROBE)清单,并符合MR的三大核心假设。整体MR设计包括三个步骤:步骤1以19,942个基因表达数量性状位点(eQTLs)为暴露因素,类风湿关节炎(RA)为结局;步骤2以1,400种代谢物为暴露因素,RA为结局;步骤3以VOPP1 eQTL为暴露因素,74种代谢物为结局。

2. 工具变量(IVs)筛选

步骤1使用的筛选标准为P值<5×10⁻⁸,连锁不平衡(LD)阈值为clumped kb=10,000且r²=0.001。步骤2使用相同的LD阈值,P值<1×10⁻⁵,且F统计量>10。步骤3使用相同的LD阈值,P值<5×10⁻⁸,且F统计量>10。

3. MR分析与敏感性分析

本研究采用R软件TwoSampleMR包进行双样本MR分析,主要分析方法为反向方差加权(IVW),并结合MR Egger、加权中位数、加权众数和简单众数等方法,P值<0.05为统计学显著。稳健性通过异质性检验、多效性评估和逐一排除(leave-one-out)分析验证,确保符合MR排他性假设。

4. GEO数据库分析

利用GEO数据库比较RA患者与健康人群滑膜组织中VOPP1的表达。

5. 人滑膜组织

正常滑膜组织样本(n=5)来自接受半月板关节镜手术的患者;RA滑膜组织样本(n=5)来自接受全膝关节置换术的RA患者。所有RA患者术前未接受改善病情抗风湿药(DMARDs)治疗,仅使用非甾体抗炎药(NSAIDs)控制症状。

6. 细胞分离与培养

组织切成小块,用II型胶原酶在含5% CO₂的37℃摇床中消化3小时,离心收集细胞后重悬于含10%胎牛血清(FBS)、100 U/mL青霉素和100 μg/mL链霉素的DMEM培养基中,培养于37℃、5% CO₂条件下,选取3-6代RA-FLSs用于实验,并用脂多糖刺激构建体外模型。

7. 蛋白印迹(Western Blot)

总蛋白用含蛋白酶及磷酸酶抑制剂的RIPA裂解液提取,SDS-PAGE分离后转移至PVDF膜,室温5%脱脂奶封闭2小时,4℃孵育一抗,洗膜后室温孵育二抗1小时,化学发光法显影,ImageJ分析条带灰度。

8. 细胞转染

VOPP1小干扰RNA(siRNA)购自GENE CREATE,序列详见原文。使用Lipofectamine 3000转染至6孔板70%融合度的细胞,48 h后收集。

9. 酶联免疫吸附试验(ELISA)

收集RA-FLSs上清及大鼠血清,按试剂盒说明检测TNF-α及IL-6水平。

10. 细胞周期与增殖检测

细胞经70%乙醇固定过夜后,PBS洗涤,染色30 min,流式细胞仪检测;EdU检测按BeyoClick EdU Kit说明进行,Hoechst染核,倒置荧光显微镜观察。

11. 统计分析

MR分析用R 4.2.1及TwoSampleMR包,细胞周期分析用NovoExpress,统计用GraphPad Prism 9.0。数据以均值±标准差(SD)表示,Shapiro–Wilk检验正态性,正态分布用t检验,非正态用Mann–Whitney U检验,P<0.05为显著差异。


小结

遗传因素在RA的易感性中起着决定性作用。RA是一种累及全身的慢性炎症性疾病,表现为关节炎症、疼痛、肿胀及结构破坏。既往研究证实,eQTLs是挖掘潜在疾病风险基因的重要工具,为揭示RA的遗传机制和发现新靶点提供了有效途径。





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