发布时间: 2025-07-07 07:53:07
免疫治疗新时代,胃癌患者迎来新希望!近年来,PD-1抑制剂虽为癌症治疗带来突破,但胃癌患者的应答率却参差不齐。如何精准筛选受益人群?如何找到更有效的治疗靶点?
最新发表在《Front Immunol》(IF=5.9)的研究给出了关键答案——长链非编码RNA CXCR2P1!研究发现,CXCR2P1不仅能显著增强肿瘤免疫浸润,还能预测患者预后,甚至通过调控microRNA机制提升PD-1抑制剂疗效!
快随小编一起解锁这一重磅研究的核心发现吧!
题目:CXCR2P1通过增加肿瘤的免疫浸润来增强胃癌对PD-1抑制剂的应答
杂志:Front Immunol
影响因子:IF=5.9
发表时间:2025.03.19
研究背景
近年来,免疫治疗已成为癌症治疗的关键手段。然而,胃癌对免疫治疗的反应表现出显著的异质性。因此,早期识别可能从免疫治疗中获益的胃癌患者并发现新的治疗靶点至关重要。
数据来源
1、使用Aspera工具从欧洲核苷酸档案库(ENA)数据库(https://www.ebi.ac.uk/ena)下载PRJEB25780项目的fastq测序数据;
2、从TIDE数据库下载PRJEB25780项目的分位数标准化(log10)每百万个映射读段的每千碱基转录本片段数(fpkm);
3、从Kim等的研究资料中下载PRJEB25780项目的临床信息;
4、从GEO数据库(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/)下载GSE193453、GSE174237、GSE84433、GSE27342、GSE135222;
5、转移性尿路上皮癌免疫治疗数据集(IMvigor210)的表达矩阵和临床信息通过“IMvigor210CoreBiologies”R包获取;
6、从KEGG数据库(https://www.kegg.jp/kegg/)下载PD-1检查点信号通路的基因集。
研究思路
作者在PRJEB25780中,进行了WGCNA分析和Lasso回归,并选择CXCR2P1进行后续分析,然后比较不同组之间CXCR2P1的表达差异。随后使用Kaplan-Meier曲线分析CXCR2P1的预后价值,并通过IMvigor210和GEO数据集进行了验证。接着使用ESTIMATE和CIBERSORT算法评估CXCR2P1对肿瘤免疫微环境的重塑作用。最后利用DEG、enrichGO、GSEA和共表达分析来探索CXCR2P1所涉及的细胞生物学功能和信号通路。
主要结果
1、CXCR2P1是胃癌免疫反应的枢纽基因之一
作者将模块与临床表型进行相关性分析,发现模块lavenderblush3与肿瘤的免疫反应相关性最高(F2D)。F2E显示GS与MM之间存在显著相关性,作者选择GS>0.2且MM>0.8的基因作为枢纽基因。为了降低枢纽基因间的共线性,还进行了lasso回归分析。在交叉验证中,当模型中的变量数减少到7个时,模型的均方误差降至最低点,方程的拟合效果达到最佳(图2G)。由于CXCR2P1影响细胞表型的机制尚不明确,因此选择其进行后续分析。
2、CXCR2P1在应答者中高表达,且与良好预后相关
胃癌患者的预后与他们对PD-1抑制剂的反应高度相关。通过分析不同的数据集,作者发现在项目PRJEB25780(F3A)和项目IMvigor210(F3B)中,应答者的CXCR2P1表达高于无应答者。在四个GEO数据集中,胃癌组织中CXCR2P1的表达高于正常组织(F3C)。通过KM曲线,作者发现CXCR2P1高组在转移性尿路上皮癌患者的OS延长(F3F),在肺癌患者的PFS延长(F3E)。
3、CXCR2P1重塑肿瘤免疫微环境
在项目PRJEB25780中,ESTIMATE分析显示CXCR2P1-high组具有更高的免疫评分(F3D)。采用CIBERSORT算法评估免疫细胞的丰度,结果显示CXCR2P1-high组中巨噬细胞(M1)、活化CD4+记忆T细胞、滤泡辅助T细胞的分数高于CXCR2P1-low组。同时,F3H所示的散点图显示,CXCR2P1的表达与巨噬细胞(M1)、活化CD4+记忆T细胞及滤泡辅助T细胞的比例均呈显著正相关,表明CXCR2P1的表达能够显著影响肿瘤免疫微环境。
4、CXCR2P1与肿瘤免疫微环境中的抗原加工和呈递相关
通过差异表达分析,发现CXCR2P1高表达组与低表达组之间有610个DEG(F4A-B)。为探究CXCR2P1的细胞生物学功能,对这些DEG进行EnrichGO和GSEA分析,结果提示CXCR2P1可能通过增强MHCII蛋白复合物在肿瘤免疫微环境中的抗原呈递,从而增加肿瘤组织中免疫细胞的浸润。
5、CXCR2P1与PD-1/PD-L1信号通路的相关性
为了探讨CXCR2P1与PD-1/PD-L1信号通路介导的肿瘤免疫逃逸的关系,作者首先分析了CXCR2P1与CD274表达的相关性,结果显示肿瘤组织中CXCR2P1与CD274的表达呈高度相关(F5B)。然后通过c2wikipathway和KEGG数据库的相关富集分析显示CXCR2P1可能通过增加免疫浸润和增强肿瘤组织中T细胞的活化来间接上调肿瘤细胞中PD-L1的表达。
6、CXCR2P1通过microRNA影响肿瘤细胞对PD-1抑制剂的反应
c2wikipathway数据库的GSEA结果显示,CXCR2P1在“肿瘤微环境中免疫细胞与microRNA的相互作用”栏目中显著富集(F6A),提示CXCR2P1可能通过microRNA调控PD-L1的表达。为了进一步明确哪些microRNA参与了CXCR2P1的上下游信号通路,作者首先对项目PRJEB25780中所有microRNA按CXCR2P1的表达情况进行DEG分析,然后对PRJEB25780中所有microRNA根据PD-1抑制剂的应答情况进行DEG分析,再将两组microRNA基因集取交集,共得到5个基因。结果显示,MIR215的表达在CXCR2P1-High组(F6J)和Responder组(F6O)中均显著下调。提示MIR215可能参与了CXCR2P1的信号通路,并作为CXCR2P1影响细胞表型的介质。
文章小结
在胃癌组织中,CXCR2P1的表达较正常胃黏膜明显升高,高CXCR2P1表达的患者预后更好,对PD-1抑制剂的疗效也更好。CXCR2P1通过促进更多的免疫细胞浸润,显著增加M1巨噬细胞、CD4+T细胞和滤泡辅助性T细胞的比例,在重塑肿瘤免疫微环境中起着至关重要的作用。在细胞水平上,CXCR2P1与肿瘤组织的炎症激活和抗原呈递增强有关。在分子水平上,CXCR2P1上调肿瘤组织中PD-L1的表达,激活参与PD-1调控的关键信号通路。这些作用可能通过lncRNA-microRNA轴介导,其中MIR215被确定为CXCR2P1的潜在直接靶点。未来的研究需通过实验验证CXCR2P1的上下游信号通路,进一步阐明其细胞生物学机制。
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